Há muitas vantagens em usar polimorfismos de único
nucleotídeo (SNPs) em investigações de paternidade ou de
identidade em comparação com o método de STR. No entanto,
uma desvantagem é a necessidade de analisar pelo menos
40-50 marcadores de SNP em vez de 13-15 lócus com o método
de STR.
A principal razão para se usar quase três vezes mais SNPs
deve-se:
A
à grande ocorrência de mutações pontuais no DNA,
principalmente nas regiões não codificantes do DNA.
B
aos STRs, que são multi-alélicos, ao passo que SNPs são em
geral bi-alélicos.
C
às frequências populacionais de SNPs serem bem menores
que as de STRs.
D
à amplificação de SNPs produzirem fragmentos de DNA
maiores que os STRs.
E
aos SNPs, que são muito raros e sua detecção requerer o
sequenciamento de DNA.