A atividade da nitrogenase, a enzima chave no processo de fixação biológica de nitrogênio, é influenciada pela disponibilidade de oxigênio no meio. Cada organismo fixador desenvolveu estratégias citadas abaixo para livrar-se do excesso de oxigênio, exceto:
procurando sítios onde a tensão de oxigênio seja baixa.
localizando a atividade de fixação do nitrogênio no centro de colônias (ex. cianobactérias) ou em células especializadas.
em sistemas mais especializados, induzindo o hospedeiro a produzir uma substância similar à hemoglobina e com a mesma função, chamada leghemoglobina, como aparece nos nódulos das leguminosas.