A microtomia consiste em utilizar um micrótomo para obter cortes sucessivos, delgados e uniformes. Tecidos destinados ao estudo por microscopia óptica são incluídos em parafina ou resinas plásticas especiais e corados em espessura de 1 a 6 cm, enquanto para microscopia eletrônica, são incluídos em resina tipo epóxi e cortados em espessura de 0,2 a 0,1 μm. Para os dois procedimentos, utilizam-se navalhas de aço.