São causas de amenorreia primária:

disgenesia gonadal, síndrome de Kallmann, deleção parcial do cromossomo X.

hímen imperfurado, hiperprolactenemia e tumor ovariano.

síndrome dos ovários policísticos, síndrome de Asherman.

doença inflamatória pélvica, disgenesia gonadal, mosaicismo dos cromossomos sexuais.

galactosemia, tuberculose e septo vaginal transverso.