Em uma criança com microcefalia os sinais e sintomas neurológicos indicam os sistemas cerebrais mais afetados; um dos aspectos a ser observado deve ser o desenvolvimento motor. São sinais de atraso motor ao final do terceiro mês:
ausência do reflexo de Moro, não percepção das mãos, move-se raramente.
reflexos tônicos cervicais persistentes , não estende mãos para alcançar objetos.
não senta sem auxílio, não acompanha objetos à distância.
não ri, não rola ou arrasta.
não leva objetos à boca, não mantém cabeça erguida em posição sentada apoiada.