Algumas enzimas digestórias são secretadas na forma de proenzimas inativas, os zimogênios, que devem ser ativados no lúmen gastrointestinal antes que possam realizar a digestão. Sintetizar as enzimas em uma forma não funcional permite que elas sejam estocadas nas células que as produzem sem causar a destruição das mesmas.
Um exemplo de zimogênio é
o quimotripsinogênio, produzido no estômago, ativado pelo hormônio gastrina no intestino e que atua na digestão de carboidratos.
o pepsinogênio, produzido no estômago, ativado pelo hormônio enterogastrona e que atua na digestão de carboidratos.
o tripsinogênio, produzido no pâncreas, ativado pela enzima enteroquinase no duodeno e que atua na digestão de proteínas.
a carboxipeptidase, produzida no fígado, ativada pela enzima tripsina no duodeno e que atua na digestão de carboidratos.
a profosfolipase, produzida pela vesícula biliar, ativada pela enzima tripsina no intestino e que atua na digestão de lipídios.