A frase pontuada corretamente é:

Pesquisadores, identificaram uma nova espécie de baleia, que era ainda desconhecida em nosso litoral porque uma delas encalhou e morreu, numa praia.

Pesquisadores identificaram uma nova espécie de baleia, que era ainda desconhecida em nosso litoral, porque uma delas encalhou e morreu numa praia.

Pesquisadores identificaram uma nova espécie, de baleia que era ainda desconhecida, em nosso litoral porque uma delas encalhou, e morreu numa praia.

Pesquisadores identificaram uma nova espécie de baleia que, era ainda desconhecida, em nosso litoral porque, uma delas encalhou e morreu numa praia.

Pesquisadores identificaram, uma nova espécie de baleia que era ainda desconhecida, em nosso litoral porque uma delas, encalhou e morreu numa praia.