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O número de biomassa dos animais e da camada autotrófica é certamente mais complexo de estimar do que o produto em pé das plantas. De acordo com ODUM, há três métodos básicos que podem ser empregados para realizar essa estimativa, são eles:
Contagem das espécies de áreas de tamanho indefinido; técnicas de marcação; coleta para identificação.
Contagem total das áreas de tamanho conhecido; técnicas de marcação e recaptura; coleta e remoção.
Análise de dados da área e do tamanho da população; captura e marcação; identificação das espécies.
Análise de dados da área e do tamanho da população; coleta de dados; identificação das espécies.