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Lagoas são exemplos de microbiota onde são encontradas várias zonas de água doce. Em um estudo microbiológico, determinada área de uma lagoa foi analisada, sendo descobertas pseudomonas e espécies de Cytophaga; Caulobacter; e, Hyphomicrobium. A zona onde foi retirada a amostra para análise consiste na superfície de uma área aberta da lagoa longe da costa e que apresenta muito oxigênio. Podemos afirmar que se trata da seguinte zona:
Bêntica.
Litorânea.
Profunda.
Limnética.