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No monitoramento da qualidade das águas naturais, são acompanhadas as alterações nas características físicas, químicas e biológicas da água, decorrentes de atividades antrópicas e de fenômenos naturais. As práticas relacionadas ao monitoramento de qualidade de água incluem a coleta de dados e de amostras de água em locais específicos (georeferenciados), feita em intervalos regulares de tempo, de modo a gerar informações que possam ser utilizadas para a definição das condições presentes de qualidade da água.
(http://pnqa.ana.gov.br.)
O monitoramento visa, ao final, permitir uma avaliação adequada da qualidade da água. Para tanto, podem ser utilizadas diversas configurações referentes
ao custo e à eficiência do procedimento metodológico adotado.
à localização, à periodicidade e aos tipos de parâmetros monitorados.
à aceitação do monitoramento pela sociedade local.
ao objetivo do uso público ou particular da água.
à quantidade de água que será consumida ou utilizada.