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A engenharia metabólica, muito utilizada para o melhoramento da performance de agentes biológicos na indústria, é definida como a modificação racional ou dirigida do metabolismo de um organismo, usando ferramentas da tecnologia do DNA recombinante e a biologia sintética.
Dentre as ferramentas acessórias dessa abordagem cíclica de melhoramento de organismos vivos, encontra-se a
transcriptômica.
análise de fluxos metabólicos.
metabolômica.
engenharia evolutiva.
protêomica.