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Três tipos de elementos funcionais são necessários para os cromossomos eucarióticos transmitirem fielmente o DNA das células-mães para as células-filhas: o centrômero que assegura a segregação cromossômica durante a divisão celular, as origens de replicação que desencadeiam a replicação do DNA e os telômeros, que têm como função:
Promover a recombinação genética entre cromossomos homólogos durante a meiose.
Cobrir as pontas dos cromossomos para impedir que o DNA seja degradado.
Atuar como origem primária da replicação do DNA em células eucarióticas.
Garantir a ligação das fibras do fuso mitótico às cromátides irmãs.
Codificar proteínas estruturais responsáveis pela compactação da cromatina.