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A microscopia de fluorescência oferece a possibilidade de se estudar estruturas celulares que não são visualizadas pela microscopia óptica convencional. Uma das abordagens consiste na utilização de anticorpos fluorescentes, por meio da imunofluorescência direta ou indireta, sendo esta última frequentemente mais vantajosa. A imunofluorescência indireta é aquela em que se
utiliza um anticorpo fluorescente que se liga diretamente à proteína de interesse.
utilizam dois anticorpos, um primeiro não fluorescente e um segundo fluorescente, que se liga ao primeiro.
utiliza um sinal fluorescente intrínseco, por meio da ligação genética de uma proteína fluorescente a uma proteína-alvo.
utiliza um corante fluorescente ácido que reage com os componentes básicos da célula.