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Os filtros mais utilizados em microscopia óptica são importantes para melhorar a visualização da amostra de estudo. Os filtros podem melhorar a cor, a intensidade ou a capacidade térmica. O filtro que indica a cor e sua correta finalidade é:
Verde – melhora o contraste da imagem.
Cinza – transforma luz amarela em branca.
Incolor – intensifica as irregularidades da iluminação.
Azul – modifica a intensidade luminosa sem interferir nas cores.