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Segundo Margulis, a existência de células procariotas é anterior à existência de células eucariotas. Assim sendo, uma semelhança fundamental entre células procariotas e eucariotas, que fundamenta a proposta de Margulis, é
a capacidade fotossintetizante.
o mecanismo de processamento pós-transcricional.
a constituição da membrana plasmática.
a presença de lisossomos e peroxisomos.
a permeabilidade da membrana nuclear.