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O sistema de expressão heteróloga em leveduras pode apresentar, como característica:
ser incapaz de secretar corretamente proteínas heterólogas glicosiladas.
ter vetores de integração cromossomal por recombinação homóloga.
somente expressar anticorpos inteiros.
ser destituído de plasmídio natural para clonagem.
não ser um organismo classificado como GRAS.