Dentre os motivos de preocupação dos cientistas com o cultivo em larga escala das variedades Roundup Ready, temos:
a reversão das variedades de soja transgênica para os tipos originais;
a diminuição da produtividade primária em cultivos transgênicos;
o aumento da incidência de mutações em cultivos transgênicos;
a transferência lateral do gene resistência para outras espécies de plantas;
a redução do genoma das variedades transgênicas ao longo do tempo.