Na classificação dos vírus se reconhece como critérios biológicos fundamentais:
O grupo taxonômico dos hospedeiros e respectivas células alvo.
A morfologia do capsídeo e suas proteínas integrantes.
O ácido nucleico utilizado como molécula informacional e seu mecanismo de replicação.
A síntese proteica e o metabolismo energético utilizado pela partícula viral.
A presença ou ausência de envoltório lipoproteico e a abordagem molecular célula-específica.