Quanto à limpeza da parte ótica do microscópio é recomendável:
proceder sistematicamente à limpeza das lentes, objetivas e oculares com um lenço de papel absorvente, como também, aspirar o pó com uma pêra de borracha.
proceder limpeza das objetivas de imersão com um lenço de papel absorvente e posterior limpeza com solução acetona etanol (7:3).
fazer a limpeza das objetivas com algodão e posteriormente com etanol.
nas objetivas de imersão, o óleo deve ser retirado com o papel absorvente.
proceder a limpeza das lentes, objetivas e oculares com etanol e lenço de papel.