Em 1904, uma lei que regulamentava a vacinação contra a varíola no Rio de Janeiro serviu de estopim para um grande levante que entrou para a história como Revolta da Vacina. O confronto entre os revoltosos e as forças governamentais foi de tal monta que o governo resolveu não votar a lei de obrigatoriedade da vacina. Com isso, uma das consequências foi
um menor índice de resistência da população à vacina nos próximos dois anos, culminando em aumento da cobertura.
a queda nos índices de vacinação com surgimento de surtos da doença, nos anos posteriores, com milhares de vítimas na cidade.
a extinção das principais doenças epidêmicas da capital da República até 1906.
a ampliação da abrangência territorial das ações de saúde para o interior do país.
o fim das campanhas sanitárias como ação de controle de doenças endêmicas e epidêmicas.