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Além de oferecer uma proteção para as pessoas, as medidas de biossegurança hospitalar visam também proteger o meio ambiente. Para isso, é imprescindível fazer o descarte adequado dos resíduos, que devem ser separados de acordo com o seu tipo para ter o destino correto. O grupo C:
são os potencialmente infectantes, ou seja, que podem ter algum agente infeccioso ou risco biológico. São recolhidos por empresas que fazem o tratamento do lixo hospitalar.
são os químicos, como corrosivos, inflamáveis e tóxicos, e devem ser recolhidos por empresa especializada.
são os resíduos radioativos que recebem o tratamento de acordo com normas específicas de biossegurança.
é o lixo comum, coletado pelo serviço municipal.
são perfurocortantes, como lâminas de bisturi e agulhas, que são descartadas em caixas especiais e coletados por empresa especializada.