As moléculas do sistema HLA são codificadas no complexo principal de histocompatibilidade, localizado no braço curto do cromossomo 6 humano. Os antígenos HLA de classe I e II estão expressos na superfície celular, apresentando grande polimorfismo genético, e são de extrema importância para a seleção do par doador-receptor de órgãos. Considerando os diferentes genes de cada classe, os genes de maior importância para o transplante, primeiramente tipados em uma análise de compatibilidade pré-transplante são:
HLA de classe I = HLA-A, HLA-B, HLA-C. HLA de classe II= HLA-DP, HLA-DQ, HLADR.
HLA de classe I = HLA-B e HLA-C. HLA de classe II= HLA-DP, HLA-DQ, HLA-DR.
HLA de classe I = HLA-A. HLA de classe II= HLA-DQ e HLA-DR
HLA de classe I = HLA-A e HLA-B. HLA de classe II= HLA-DR.
HLA de classe I = HLA-B e HLA-C. HLA de classe II= HLA-DR.