Na Idade Média, a filosofia escolástica era toda determinada pelo cristianismo. Por causa disso, a metafísica grega foi profundamente reformulada, a fim de adequar-se ao dogma cristão da criação divina do universo. Com isso, a escolástica distinguiu três diferentes espécies de metafísica, às quais correspondem três diferentes espécies de ser, a saber:
teologia (ser de Deus); psicologia racional (ser da alma humana); cosmologia racional (ser das coisas naturais).
deontologia (ser de Deus); ontologia (ser lógico); fisiologia (ser natural).
deontologia (ser de Deus); dialética (ser do ente racional) ; alquimia (ser da matéria).
teologia (ser de Deus); ontologia (ser da alma racional); psicologia (ser da alma animal).
teosofia (ser de Deus); teologia (ser da alma divina); fisiologia (ser da alma animal).