Um hotspot, que também pode ser chamado de hotspot de biodiversidade, é uma área que sofreu degradação significativa e possui rica biodiversidade que sofre ameaças de extinção.
Nesse contexto, são considerados os hotspots brasileiros:
Amazônia e Mata Atlântica.
Cerrado e Mata Atlântica.
Amazônia e Cerrado.
Amazônia e Pantanal.