Os processos de fossilização atuam, de forma diferente, sobre as várias partes do organismo a serem preservadas. Nos vertebrados fósseis, raramente encontra-se tecido não mineralizado preservado. No Brasil, algumas exceções a essa regra são representados por fósseis procedentes da Bacia do Araripe. Quando há essas exceções, o procedimento adequado é
empregar o método conhecido como peeling, isolando o tecido não mineralizado.
determinar a estratégia de preparação após estabelecer a natureza de preservação.
utilizar ultrassom para caracterizar os materiais resultantes de alterações diagenéticas.
utilizar a tomografia computadorizada, para evitar danos ao material, conforme avanços realizados recentemente.