De acordo com a Resolução Coun nº 78, de 22 de setembro de 2011, são competências do Conselho Universitário, EXCETO:
Compete ao Conselho Universitário elaborar e aprovar o Regimento Geral da UFMS, alterando-o quando necessário.
Compete ao Conselho Universitário estabelecer as políticas institucionais de gestão de pessoas.
Compete ao Conselho Universitário aprovar proposta de criação, de expansão, de suspensão temporária e de extinção de cursos de graduação e de cursos de pós-graduação stricto sensu, ouvidos os Conselhos competentes.
Compete ao Conselho Universitário opinar sobre a criação, implantação, alteração e extinção de Unidades da Administração Central, de Unidades da Administração Setorial e de Unidades Suplementares, bem como aprovar normas relativas à gestão de pessoas.
Compete ao Conselho Universitário aprovar o Código de Ética e o Regime Disciplinar da UFMS.