A imunossupressão de manutenção é usualmente realizada com terapia tripla, composta de tacrolimus, micofenolato e esteroides.
As rejeições agudas, mesmo tratadas adequadamente levam a uma perda de função e diminuição da vida útil do transplante.
As anomalias congênitas do tipo amputações transversas podem potencialmente ser tratadas com transplantes.
A rejeição dos transplantes de tecidos compostos ocorre por diferentes mecanismos nos diferentes tecidos, por exemplo, os músculos sofrem um processo de rejeição mediada por anticorpos.