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Os CTD são utilizados em conjunto com garrafas de amostra de água para:
permitir a otimização das coletas de dados, em função da baixa taxa de aquisição do CTD.
realizar medidas de temperatura potencial a partir de termômetros de inversão acoplados às garrafas.
obter informações de temperatura e salinidade, a partir de amostras de água nas camadas profundas, onde os sensores do CTD geralmente apresentam desvios elevados.
permitir a coleta de amostras de água para fins de estudos termohalinos.
permitir tanto a calibração, principalmente do sensor de condutividade, quanto as análises químicas e biológicas das amostras de água.