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Sabe-se que a superfície das mucosas e da pele do organismo humano é colonizada por uma microbiota característica. São raras as regiões do corpo humano que não apresentam bactérias, como por exemplo, o cérebro. De acordo com a microbiota oral, o principal agente etiológico da cárie, caracterizado por seu metabolismo predominantemente fermentativo, é denominado:
Treponema denticoa.
Lactobacillus dentalis.
Actinomyces forsythia.
Prevotella intermedia.
Streptococus mutans.