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Em algumas doenças, a imunidade sistêmica não é tão importante quanto a imunidade local. Nessas circunstâncias, torna-se mais apropriado administrar a vacina no local da invasão potencial, tal como no caso do patógeno
Rickettsia rickettsii
Streptococcus equi.
Streptococcus thermophilus.
Borrelia burgdorferi.
Lentivirus equino.