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As micotoxinas são metabólitos tóxicos secundários produzidos por fungos filamentosos. Esses fungos crescem e se proliferam bem em grãos quando em condições ideais de temperatura, umidade e presença de oxigênio. As principais micotoxinas de ocorrência em grãos e subprodutos utilizados na nutrição animal no Brasil são:
Aflatoxina, patulina, fumonisina e tricoteceno
Fumonisina, aflatoxina, aspergillus e ácido penicílico
Zearalenona, ocratoxina, aflatoxina, citrinina
Tricotecenos, ocratoxina, aflatoxinas e fumonisinas