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O modo ideal para controle de infecções por Micoplasmose em estabelecimentos é a erradicação; no entanto, nem sempre isso é possível devido à propagação lateral. Caso seja necessária a escolha de antimicrobiano para tratamento de Micoplasmoses, é adequado escolher:
Primeira escolha: Benzilpenicilina; segunda escolha: Sulfonamidas.
Primeira escolha: Sulfonamidas potencializadas; segunda escolha: Aminopenicilinas.
Primeira escolha: Tiamulina; segunda escolha: Tetraciclinas - lincomicina.
Primeira escolha: Enrofloxacina; segunda escolha: Aminopenicilinas.