O aumento de patologias emergentes causadas por...

O aumento de patologias emergentes causadas por microrganismos conhecidos ou mesmo não conhecidos demanda o uso de técnicas cada vez mais eficazes e de rápida aplicação para efeitos diagnósticos e de identificação desses microrganismos, com desdobramentos para a pesquisa científica e microbiologia clínica. A espectrometria de massas tipo MALDI-TOF surge como uma tecnologia que pode ser aplicada na identificação de microrganismos, detecção de resistência antimicrobiana e fatores de virulência, identificação de painéis biomarcadores, tipificação de cepas, entre outras aplicações. Dessa forma, o desenvolvimento da tecnologia e suas aplicações, seja para a pesquisa científica, seja para o desenvolvimento de atenção à saúde animal e humana, é de grande interesse.

Num contexto hipotético, temos um cenário de contaminação de animais bovinos de produção que passaram a apresentar sintomas clínicos importantes de uma infeção bacteriana de glândulas mamárias, cujo tratamento convencional com antibiótico ampicilina não resultou em um processo de cura. Pelo contrário, a taxa de animais infectados e doentes seguiu aumentando após a administração do antibiótico citado. Com base nessas informações, responda aos seguintes questionamentos:

1) Em se tratando da identificação do agente causador da doença, descreva quais estratégias e metodologias devem ser utilizadas para coletar, isolar e caracterizar microbiologicamente a bactéria causadora da doença dos animais infectados.

2) Quais seriam os procedimentos e metodologias utilizadas por você para o preparo de amostras para identificação da espécie da bactéria causadora da infecção, utilizando a espectrometria de massas tipo MALDI-TOF?

3) Explique e descreva o fluxo de análise computacional que deve ser realizado dos espectros e demais dados obtidos da análise por espectrometria de massas do tipo MALDI-TOF do isolado bacteriano em estudo para identificar a espécie da bactéria desconhecida.