Os métodos de biomonitoramento auxiliam na avaliação da qualidade ambiental através da reação de organismos frente a um agente estressor.
Os métodos de biomonitoramento podem ser divididos em ativos e passivos. Enquanto no ativo há exposição de organismos na área a ser avaliada por um tempo definido em condições controladas, no passivo,
são utilizados organismos naturalmente existentes em uma determinada área.
há a exposição de organismos na área a ser avaliada por um tempo indefinido, sem controle das condições.
os animais são necessariamente mortos para permitir a observação da reação de seus órgãos, como o fígado.
observam-se somente as reações comportamentais dos animais, sem a necessidade de matá-los.
realiza-se o biomonitoramento com organismos sésseis, como algas e mexilhões, devido à incapacidade motora desses organismos.