O desenho de oligonucleotídeos iniciadores (primers) na
reação em cadeia da polimerase, visando às análises forenses
de DNA, deve considerar:
A
a utilização de regiões altamente conservadas do DNA
humano, garantindo a amplificação de diferentes
populações
B
a utilização de regiões que apresentem alta variação,
garantindo a ligação com DNA de outras espécies e
ampliando o poder resolutivo da análise.
C
a construção de primers grandes, com mais de 400
nucleorídeos, aumentando a eficiência da ligação, e
conseqüentemente, também da amplificação.
D
a utilização de sequências preferencialmente ricas em G/C
ou ricas em A/T , o que evita a possibilidade de surgimento
de regiões de pareamento dentro do primer, e a formação
de looping, que resulta em primers dímeros.
E
a utilização de qualquer tamanho ou seqüência, pois não
há qualquer interferência destes fatores na reação.