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A teoria da endossimbiose enuncia que duas organelas presentes em células eucarióticas foram, em algum momento, células procarióticas independentes. Tal teoria é apoiada, entre outras coisas, no fato de que essas organelas possuem um DNA próprio, diferente do DNA nuclear. As duas organelas celulares citadas na teoria da endossimbiose são:
complexo de Golgi e mitocôndria
mitocôndria e cloroplasto
cloroplasto e complexo de Golgi
lisossomo e complexo de Golgi
lisossomo e mitocôndria