Em protocolos de seqüenciamento de DNA a introdução de 7-deaza-citidina é necessária sempre que a seqüência a ser determinada:
A
for maior do que 400 pares de base;
B
for rica em nucleotídeos G e C;
C
apresentar um conteúdo A/T maior que 70%;
D
estiver muito próxima ao oligonucleotídeo iniciador da síntese;
E
estiver sendo realizada através do método químico.