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A determinação e escolha de um primer ou par de primers a ser utilizado em um experimento de PCR, ou baseado em PCR, requer uma série de cuidados para garantir a qualidade da reação e a ausência de falsopositivos e falso-negativos. De acordo com as características do primer, marque a alternativa correta.
Os primers forward (F) e reverse (R) devem apresentar sequências complementares entre si, para garantir a ligação na posição alvo do DNA.
Quanto maior o número de bases Citosina (C) e Guanina (G) no primer, mais fortemente “ligados” estarão o primer e o DNA template. Logo, o conteúdo de bases C e G de um primer determina a temperatura na qual a reação de pareamento deve ocorrer.
A temperatura de melting (Tm) é a temperatura na qual ocorre o pareamento total entre primer e DNA template.
A temperatura de anelamento (Ta) é definida como a temperatura na qual metade dos fragmentos de DNA está na forma desnaturada, ou seja, não pareada, e a outra metade está pareada.