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Os exames para o diagnóstico laboratorial em saúde pública compreendem três etapas, a pré-analítica, a analítica e a pós-analítica. Na fase pré-analítica, os procedimentos para coleta da amostra e o seu encaminhamento são fundamentais para se garantir a qualidade no laboratório. Assim, no diagnóstico laboratorial de botulismo, se a pesquisa de toxina botulínica for feita em
fezes ou conteúdo intestinal, o período máximo de coleta é um mês e a conservação deve ser feita à temperatura ambiente.
lavado gástrico, a coleta deve ser feita em até 48h e conservada em tubo sem anticoagulante.
exsudato do ferimento, a coleta deve ser realizada na parte mais profunda do ferimento, com auxílio de um suabe.
soro, a coleta deve ser feita com coletor universal estéril à temperatura ambiente, e o tempo de transporte em até 48h.
tecido, o transporte da amostra deve ser à temperatura de 20 ºC negativos, e o tempo de transporte não deve ultrapassar 24h.