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Os cientistas estudam muitos caracteres em espécies diferentes para deduzir quais desses caracteres podem ser usados para construir uma árvore evolutiva. Somente determinados caracteres são evidências de ancestralidade comum e podem ser usados para reconstruir as relações evolutivas entre diferentes espécies.
A ilustração a seguir representa a linhagem evolutiva de alguns animais vertebrados, destacando a anatomia dos membros anteriores desses animais:

(https://evolution.berkeley.edu/semejanzas-y-diferencias-nivel-bachillerato/usemos-las-homologias-para-reconstruir-las-relaciones-evolutivas. Adaptado)
Com relação a essa linhagem, verifica-se que os números de 1 a 5 representam a ancestralidade desse grupo, de tal forma que é possível concluir que o ancestral
1 representa ancestral comum responsável pela convergência adaptativa dos membros anteriores do grupo.
2 representa um caráter homólogo que foi herdado pelos animais representados pelo cladograma.
3 representa um ancestral comum cuja característica convergente evoluiu separadamente.
4 representa um ancestral comum a um grupo que tem como caráter homólogo o polegar opositor.
5 representa um ancestral comum que origina linhagens diferentes que se adaptaram a um mesmo modo de vida.