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Durante o processo de desenvolvimento de uma vacina profilática contra um vírus zoonótico emergente, uma equipe de pesquisa emprega abordagens proteômicas com o objetivo de identificar potenciais antígenos candidatos. Para isso, proteínas virais são isoladas a partir de culturas celulares infectadas, submetidas à eletroforese bidimensional (2-DE) e, posteriormente, analisadas por espectrometria de massas para caracterização molecular.
Qual abordagem experimental a seguir seria melhor para seleção racional de proteínas imunogênicas relevantes?
Priorizar proteínas com maior massa molecular, partindo da premissa de que seu tamanho confere maior potencial imunogênico.
Comparar os perfis proteômicos de células infectadas e não infectadas, a fim de detectar proteínas diferencialmente expressas e associadas à resposta imune.
Restringir a análise às proteínas estruturais do vírus, desconsiderando proteínas não estruturais por sua suposta baixa imunogenicidade.
Basear-se unicamente em bibliotecas de cDNA viral para inferir os candidatos antigênicos, sem necessidade de validação proteômica funcional.
Substituir a eletroforese 2-DE por técnicas não baseadas em separação por ponto isoelétrico, devido à alegada limitação de resolução em amostras complexas.