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Há vários sistemas que disponibilizam ferramentas específicas para a gestão de coleções biológicas científicas. O ideal é que o sistema de gerenciamento possibilite a interoperabilidade e facilidade de exportação de dados em plataformas que organizam, armazenam e disponibilizam dados sobre a biodiversidade, como, por exemplo, o Sistema de Informação sobre a Biodiversidade Brasileira (SiBBr).
Alguns dos sistemas utilizados no Brasil e suas propriedades técnicas estão corretamente descritas em:
BRAHMS: sistema de pesquisa e gerenciamento de coleções zoológicas, botânicas e de microrganismos.
BRAHMS: todas as versões são abertas e gratuitas, mas não permitem integração com o Integrated Publishing Toolkit (IPT).
JABOT: sistema de gerenciamento de coleções botânicas, com licença livre, possibilita importação e exportação em DarwinCore.
JABOT: hospedagem paga em nuvem, integração a ser implementada com a Flora e Funga do Brasil 2020.
Specify: sistema de gerenciamento específico para herbários, com licença gratuita e livre, mas não permite integração com o Integrated Publishing Toolkit (IPT).