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A antropização dos biomas brasileiros tem alterado não apenas a composição das espécies, mas também os processos ecológicos fundamentais. Entre as consequências funcionais mais relevantes dessas alterações, destaca-se:
A estabilização dos fluxos de energia, favorecida pela substituição da vegetação nativa por pastagens e monocultivos.
A ampliação da diversidade funcional devido à introdução de espécies exóticas de diferentes origens ecológicas.
A manutenção do equilíbrio ecológico, uma vez que espécies generalistas e invasoras compensam as funções das espécies extintas.
O aumento da capacidade de resiliência dos ecossistemas, decorrente da homogeneização das paisagens e da simplificação das cadeias tróficas.
A redução da ciclagem de nutrientes e da produtividade primária, decorrente da perda de espécies-chave e da degradação do solo.