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A prática de biologia molecular encerra um conjunto amplo de protocolos padronizados e o uso de diferentes tecnologias disponibilizadas em equipamentos específicos. Dentre os equipamentos utilizados em experimentação de biologia molecular podemos apontar:
Espectrofotômetro; leitor de ELISA e microscópio óptico.
Termociclador tipo qPCR/RT-qPCR; transiluminador e freezer - 80C.
Termociclador tipo PCR; Sequenciador de nucleotídeos e Sistema de eletrofores em gel.
Cromatógrafo; espectropolalímetro de dicroismo celular e Sistema de eletroforese em gel.