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O controle de qualidade em Citopatologia é fundamental para assegurar a confiabilidade dos resultados, reduzir falhas nas diferentes etapas do processo e aprimorar continuamente o desempenho dos laboratórios. No Brasil, o INCA estabelece recomendações para o monitoramento da qualidade dos exames citopatológicos, considerando características particulares desse tipo de diagnóstico, como sua natureza qualitativa e a influência da interpretação do observador. Considerando os princípios básicos do controle de qualidade aplicados aos laboratórios de Citopatologia, um exemplo de medida de controle interno da qualidade consiste em:
ações sistemáticas realizadas pelo próprio laboratório, como monitoramento da adequabilidade das amostras, revisão de exames, acompanhamento de indicadores e identificação de não conformidades, permitindo a adoção de medidas para melhoria contínua do processo
calibração periódica dos microscópios, não incluindo avaliação dos resultados citopatológicos ou do desempenho dos profissionais responsáveis pelo escrutínio
realização somente quando for identificada discordância entre os resultados citológicos e histopatológicos, não sendo necessária sua aplicação sistemática na rotina laboratorial
execução exclusivamente por instituições externas ao laboratório, sem participação dos profissionais responsáveis pelo processamento, escrutínio ou liberação dos exames