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As reações alérgicas e as imunodeficiências representam alterações distintas do funcionamento do sistema imunológico e, por isso, sua investigação laboratorial utiliza diferentes estratégias. Nas reações de hipersensibilidade imediata, a sensibilização a determinados alérgenos pode ser investigada pela detecção de IgE específica, enquanto a avaliação da competência imunológica pode envolver análises quantitativas e funcionais dos diferentes componentes da resposta imune. Considerando esses fundamentos, a relação entre os testes laboratoriais e os componentes do sistema imunológico avaliados consiste no fato de que a:
dosagem de IgE total permite identificar especificamente o alérgeno responsável pela reação alérgica, enquanto a dosagem sérica de IgG isoladamente é suficiente para avaliar todas as funções da imunidade celular e humoral
pesquisa de IgE específica pode demonstrar sensibilização a determinado alérgeno e deve ser interpretada em conjunto com a história clínica; na investigação da função imune, a dosagem de imunoglobulinas, a avaliação da resposta de anticorpos a antígenos específicos e a análise de subpopulações linfocitárias podem ser utilizadas conforme o componente imunológico sob investigação
pesquisa de IgG específica contra alimentos constitui o método preferencial para diagnosticar alergias alimentares mediadas por IgE, enquanto a contagem total de leucócitos é suficiente para excluir alterações da imunidade humoral
avaliação laboratorial da função imune baseia-se exclusivamente na determinação das concentrações séricas de IgE, pois alterações das células T, células B e do sistema complemento não podem ser investigadas por métodos laboratoriais