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A bactéria Helicobacter pylori é um patógeno causador de processos inflamatórios na mucosa do estômago e duodeno dos seres humanos. As secções coradas de biopsia gástrica podem evidenciar a presença dessa bactéria por meio da sua capacidade bioquímica de:
reduzir o nitrato em nitrito
hidrolisar a ureia pela urease
produzir H₂S a partir da cisteína
fermentar a glicose com produção de CO₂