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Na vigilância sanitária de alimentos, a análise microbiológica para pesquisa de coliformes termotolerantes constitui indicador de contaminação fecal. O microrganismo do grupo dos coliformes termotolerantes que indica especificamente contaminação de origem fecal recente, sendo considerado padrão de qualidade microbiológica de água e alimentos, é:
escherichia coli
salmonella spp não tifoide.
bacillus cereus toxigênico.
clostridium perfringens esporulado.
staphylococcus aureus coagulase positiva.