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A técnica de RT-PCR (Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction), amplamente utilizada para o diagnóstico de vírus de RNA, difere fundamentalmente da PCR convencional (padrão) em uma etapa crucial. A diferença essencial é que a RT-PCR
utiliza temperaturas de desnaturação muito mais baixas (cerca de 55°C) em comparação com a PCR padrão, que usa 95°C, para proteger a molécula de RNA da degradação.
realiza a amplificação exponencial do DNA alvo diretamente a partir da amostra de RNA, sem a necessidade de uma etapa intermediária de síntese de DNA.
incorpora uma etapa inicial de transcrição reversa, que converte a fita de RNA viral em uma fita complementar de DNA (cDNA), que é então amplificada pela PCR padrão.
permite o sequenciamento direto do RNA amplificado no mesmo tubo de reação, o que não é possível com a PCR padrão.