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O INCQS é o laboratório oficial da rede, responsável pelo controle da qualidade de insumos, produtos, ambientes e serviços sujeitos à ação da Vigilância Sanitária. Dentre outras atividades, podemos destacar, EXCETO:
executa ações analítico-laboratoriais
emite pareceres técnico-científicos
elabora normas técnicas e procedimentos operacionais padronizados (POPs)
inspeciona, independente dos demais entes da SNVS, indústrias e laboratórios
estabelece e distribui substâncias químicas e microorganismos de referência